Κόντρα μεταξύ του Γιάννη Πανούση και του Νίκου Παρασκευόπουλου προκάλεσαν τα δημοσιεύματα που έκαναν λόγο για ελέγχους της αστυνομίας σε κελιά όπου κρατούνται μέλη της Συνωμοσίας Πυρήνων της Φωτιάς, στον Κορυδαλλό.
Ο υπουργός Δικαιοσύνης Νίκος Παρασκευόπουλος, σε απάντηση της ανακοίνωσης του συναδέλφου του αναπληρωτή υπουργού Προστασίας του Πολίτη Γιάννη Πανούση σχετικά με τα κείμενα διαμαρτυρίας που αναφέρονται στις έρευνες, δήλωσε τα εξής:
«Οι αστυνομικοί δέχονται εντολές μόνο από την υπεύθυνη ιεραρχία. Επομένως αποκλείεται να έχουν δεχθεί εντολές από "άλλους, οι οποίοι και πάλι κρύβονται". Κατά τα λοιπά, έρευνες στα κελιά προβλέπονται και διεξάγονται, τακτικές ή έκτακτες, είτε με εντολές της ηγεσίας του υπουργείου Δικαιοσύνης, είτε και υπηρεσιακά από το αρμόδιο προσωπικό της σωφρονιστικής διοίκησης».
Ακόμη, τόνισε ο κ. Παρασκευόπουλος, «η ηγεσία και τα στελέχη του υπουργείου Δικαιοσύνης, Διαφάνειας και Ανθρώπινων Δικαιωμάτων, όχι μόνο δεν κρύβονται αλλά αντιθέτως πολύπλευρα στοχοποιούνται».
Προηγουμένως, ο κ. Πανούσης είχε δηλώσει ότι ουδέποτε έδωσε εντολή για έρευνες στα κελιά προσθέτοντας: «Δεν έχω καμία ανάμιξη στις πρωτοβουλίες του υπουργείου Δικαιοσύνης και θεωρώ απαράδεκτο να εμπλέκεται το όνομά μου, προκειμένου να κρύψουν τα ανομήματα τους ορισμένοι υπόγειοι, διπρόσωποι τάχα δικαιωματίες. Ούτε ως επιστήμονας, ούτε ως υπουργός, συμφωνώ με την εμπλοκή της Αστυνομίας σε τέτοιες δράσεις. Άρα η εντολή έχει δοθεί από αλλού και από άλλους, οι οποίοι και πάλι κρύβονται...».