Ο Τομεάρχης Εθνικής Άμυνας της Νέας Δημοκρατίας, Βασίλης Κικίλιας, σχολιάζοντας της αλλαγή φρουράς στην ηγεσία των Ενόπλων Δυνάμεων, αναφέρει σε δήλωση του, ότι «ο κ. Τσίπρας, λίγες ώρες μετά τη ζημιογόνο για τα εθνικά συμφέροντα Συμφωνία των Πρεσπών, αποφάσισε να κάνει κρίσεις ημετέρων στις Ένοπλες Δυνάμεις».
Συμπλήρωσε δε ότι «αγνοώντας κάθε έννοια αξιοκρατίας και αποστρατεύοντας ικανότατα στελέχη, επιβεβαίωσε για μια ακόμη φορά και σε μια τόσο κρίσιμη εποχή, την έλλειψη σεβασμού προς τις Ένοπλες Δυνάμεις της πατρίδας. Το παρήγορο είναι πως δεν θα ξαναγίνουν κρίσεις με αυτόν στο τιμόνι της χώρας».
Αντίθετα ο Πρόεδρος των ΑΝΕΛ, Πάνος Καμμένος, σε ανάρτηση του στο Twitter, σχολιάζει, «συγχαρητήρια στους νέους Αρχηγούς Επιτελείων. Τεράστια απώλεια για το Στράτευμα ο Αντιστράτηγος Στεφανής έως τώρα ΑΓΕΣ. Καλή επιτυχία στο έργο αυτών που παραλαμβάνουν και ένα μεγάλο ευχαριστώ σε όσους φεύγουν. Είμαι περήφανος που υπηρέτησα μαζί σας. Η Υπέρμαχος Στρατηγός μαζί σας» .