Αλαλούμ προκαλούν οι αλλαγές του ΦΠΑ, που περιέχονται στην εγκύκλιο για τα νησιά. Όπως έχει ήδη ειπωθεί, ο ΦΠΑ στα νησιά θα προσαρμοστεί σε δύο κατηγορίες. Οι διευκρινίσεις, ωστόσο για την κατά περίπτωση εφαρμογή του, φαίνεται πως έχουν ήδη προκαλέσει σύγχυση.
Ακτοπλοϊκά εισιτήρια. Η μετάβαση από τον Πειραιά στη Φολέγανδρο επιβαρύνεται με ΦΠΑ 23%. Την ίδια στιγμή, αν η μετάβαση γίνει από την Άνδρο προς τη Φολέγανδρο, η επιβάρυνση είναι της τάξης του 16%.
Νωπό κρέας. Διάθεση νωπού κρέατος από επιχείρηση με έδρα τη Μύκονο παραδίδει το προϊόν σε κατάστημα με έδρα τη Ρόδο και υποκαταστήματα στη Σύρο και τη Σάμο, οπότε και το τιμολόγιο εκδίδεται με ΦΠΑ 9%. Στην περίπτωση που η ίδια επιχείρηση διαθέσει το νωπό κρέας σε επιχείρηση της Αττικής, ο συντελεστής θα προσαρμοστεί στο 13%.
Η κατάργηση της έκπτωσης 30% στα νησιά της Μυκόνου, της Σαντορίνης, της Ρόδου, της Σκιάθου, της Πάρου και της Νάξου, έχει δημιουργήσει «πονοκέφαλο» στους επιχειρηματίες και τους κατοίκους τους, ενώ οι λογιστές βρίσκονται σε ετοιμότητα, ώστε να προλάβουν λάθη σε τιμολόγια, που μπορεί να στοιχήσουν πολύ ακριβά. Σημειώνεται ότι από την 1η Οκτωβρίου οι συντελεστές των προαναφερθέντων νησιών αυξήθηκαν στο 6, 13 και 23%, από το 4, 9 και 16% που ήταν προηγουμένως. Ταυτόχρονα, οι προηγούμενοι συντελεστές ισχύουν στα υπόλοιπα νησιά, για τα οποία ο νόμος προβλέπει τη σταδιακή κατάργησή του ως το τέλος του 2016.
Η γενική γραμματέας Δημοσίων Εσόδων, Κατερίνα Σαββαΐδου, εξέδωσε εγκύκλιο, στην οποία αναφέρονται παραδείγματα, με σκοπό την επίλυση των προβλημάτων εφαρμογής των συντελεστών ΦΠΑ.
Παραδείγματα
1. Στα ακτοπλοϊκά εισιτήρια οι επιβάτες που αναχωρούν από τον Πειραιά επιβαρύνονται με συντελεστή ΦΠΑ 23%, ανεξαρτήτως του προορισμού τους. Αν έχουν εισιτήριο από την Άνδρο με προορισμό την Τήνο επιβαρύνονται με ΦΠΑ 16% (ισχύει η έκπτωση ΦΠΑ 30%), ενώ αν ο προορισμός τους είναι η Μύκονος από την Άνδρο, τότε το εισιτήριο θα έχει ΦΠΑ 23% γιατί η Μύκονος έχει χάσει την έκπτωση του ΦΠΑ.
2. Μια επιχείρηση στη Νάξο παραδίδει παραδοσιακά γαλακτοκομικά προϊόντα που παράγονται από τον συνεταιρισμό του νησιού σε επιχειρήσεις που βρίσκονται στην Κω, τη Λέσβο και τη Χίο, αποστέλλοντας τα αγαθά στα νησιά αυτά. Οι πράξεις αυτές υπάγονται στον συντελεστή 9%. Εάν όμως ο παραλήπτης είναι ιδιώτης η συναλλαγή θα επιβαρυνθεί με ΦΠΑ 13%.
3. Επιχείρηση εγκατεστημένη στη Θήρα παραδίδει τυποποιημένα όσπρια (φάβα) σε επιχείρηση με έδρα την Αθήνα, σε επιχειρήσεις εγκατεστημένες στη Μύκονο και τη Νάξο, καθώς και σε φυσικά πρόσωπα πελάτες στην Εύβοια, την Κρήτη και τη Σαλαμίνα. Όλες οι ανωτέρω πράξεις υπάγονται στον συντελεστή ΦΠΑ 13%.
4. Υποκείμενος που διαθέτει επιχείρηση στη Μύκονο παραδίδει νωπό κρέας σε κατάστημα πώλησης τροφίμων (σούπερ μάρκετ) που έχει έδρα τη Ρόδο και υποκαταστήματα στη Σάμο και τη Σύρο. Για την ανωτέρω παράδοση τιμολογεί την έδρα της επιχείρησης στη Ρόδο και αποστέλλει τα πωλούμενα αγαθά στα υποκαταστήματα της επιχείρησης. Οι πράξεις αυτές υπάγονται στον συντελεστή 9%.
5. Υποκείμενος που είναι εγκατεστημένος στην Πάρο παραδίδει σε ιδιώτη πελάτη του ένα μηχάνημα ψύξης - θέρμανσης και το παραδίδει με ευθύνη του στην οικία του στην Αντίπαρο.
Η συναλλαγή αυτή υπάγεται στον κανονικό συντελεστή 23% παρότι η Αντίπαρος ανήκει στην κατηγορία των νησιών που υπάγονται στους χαμηλούς συντελεστές, καθώς το πρόσωπο που λαμβάνει τα αγαθά είναι ιδιώτης. Το ίδιο πρόσωπο - λήπτης των αγαθών διαθέτει επίσης ατομική επιχείρηση και αγοράζει αντίστοιχο μηχάνημα για τον εξοπλισμό των τουριστικών καταλυμάτων που διαθέτει στην Αντίπαρο από τον ίδιο πωλητή ο οποίος το μεταφέρει σε αυτόν.
Η συναλλαγή αυτή υπάγεται στον συντελεστή 16%.
6. Μηχανικός εγκατεστημένος στη Ρόδο παρέχει υπηρεσίες επιτόπιας επίβλεψης της ανέγερσης τουριστικών κατοικιών στην Κάρπαθο. Οι εν λόγω υπηρεσίες υπάγονται στον συντελεστή ΦΠΑ 23%.